日本外交部除了已向中方提出抗议，还决定自己翻译该公报的中文版，对北京表示了极不信任的态度。日本媒体认为，这一事端给正平稳走入正轨的中日关系种下火种，给两国同意了的“战略互惠关系”泼冷水。

指中国删掉日本提出两建议

　　据报道，本月1日，中日在北京的人民大会堂召开高层经济对话，对两国的经济问题达成了多项协议。现在，日本方面感到不满的是，中国一些官方媒体发表的公报内容，与两国共同协商好的文件有出入。

　　据报道，日方指中国删掉日本提出的两个建议。一、希望看到人民币升值；二、催促中国参与签署“能源宪章条约”，以让能源领域的投资自由化。

　　日本代表在该会议结束后的当天晚上，就已在北京的日本大使馆内，向日媒体公开联合公报内容。隔天，日本六位参与该会议的部长与中国总理温家宝会谈，双方都对此次会议的“成功”感到满意。日本外长高村正彦还指出：“两国能一起发表联合公报，这是最大的成功。”

　　可是，到了第三天，日方看到中国新华社发表的该份《联合公报》，发现少了两个日本视为关键的意见。

　　日本外交部随即向中方提出抗议，要求它更正所发表的公报内容。同时，也吩咐官员按照日文内容重新翻译中文版，然后在日本的外交部网页上加以公布。

　　据日本官员向媒体分析，中国对发表联合公报有保留，这是因为不愿白纸黑字留下一些对其不利的意见。
日本不满中国 没如实公布《经济联合公报》内容

　　对此一事端，日本官员中也陆续传出不满的声音。一些人表示：“私自进行更改，就是损害两国的信赖关系。”一些不客气者则指出：“这在外交上是不容原谅的暴力举动”。
　　中日自着重发展经济关系后，两国间已少了许多争端。近期，日本外交部也因看重中日经济合作，大大增加处理中日交流事务的人员。另外，为进一步加强关系，日相福田康夫也多次对外表示，希望尽早访问中国。

　　《朝日新闻》昨天在头版报道了中国没有如实公布该联合公报一事，它指出，要平息风波且看中国的对应，唯恐这一事端使得福田访华出现变数。